miRNA 调控网络


简介:

miRNA 调控网络是指miRNA与其靶基因之间的调控网络。分析过程中主要涉及以下步骤:

1. 预测miRNA 结合的靶基因(这个很多数据库以及软件可以实现这一步骤)

2. 跟转录组的数据结合,筛选其中差异表达miRNA及靶基因

3. 结合统计方法计算miRNA在所有差异基因调控的权重,辅助筛选重要的miRNA

4. 其他辅助手段,筛选重要的miRNA

5. 最终以网络的方式呈现


Demo 结果


Network-Based Approaches to Understand the Roles of miR-200 and Other microRNAs in Cancer

Cameron P. Bracken et al. 2015,cancer research

结果解读:

结果中显示了 microRNA 与 特定生物学相关mRNA 之间的关系

分析关键:

1. 预测的软件比较多,如何筛选预测的结果

2. 如何使预测的结果真实性更高

3. 当没有miRNA表达或mRNA表达的数据的时候缩小数据的范围

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