ceRNA 调控网络


简介:

ceRNA机制是指一些分子比如circRNA,lncRNA通过竞争性结合miRNA从而保护 mRNA 不受 miRNA 的降解。基于基因的表达值,通过相关性分析以及种子序列的匹配的方法,建立microRNA 的海绵吸附作用的调控网络。

ceRNA demo

网络图:



图中:下三角(红色)miRNA, 椭圆(天蓝色)mRNA 菱形(绿色)lncRNA. M23616就是我们关注的lncRNA

桑葚图

结果解读:

展示ceRNA机制的图有多种,可以按需求选择

分析关键:

1. 是否有circRNA/LncRNA,mRNA表达的数据

2. 是否有关注的特定的circRNA/LncRNA,mRNA

-END-