简介：

microRNA(miRNA)是一类长度很短的非编码调控单链小分子RNA，约20~24 nt(少数小于20 nt的)，由一段具有发夹环结构的长度为70~80 nt 的单链RNA 前体(pre-miRNA)剪切后生成。通常认为miRNA通过与其目标mRNA分子的3'端非编码区域(3'-untranslated region, 3' UTR)互补匹配导致该mRNA分子的翻译受到抑制。除此以外，miRNA也是ceRNA 机制中的重要桥梁。

分析内容：

1.   已知miRNA的表达量统计

注：Bleckmann, A., et al. Molecular Oncology (2014)

2.   已知miRNA的家族分析（需要提供参考物种拉丁文名称）

3.   样品间miRNA的差异分析（2个或2个以上样品）和聚类分析（3个或3个以上样品）

Bleckmann, A., et al. Molecular Oncology (2014)

4.   miRNA靶基因的预测(需要提供基因的编码序列)

miRNA靶基因多数通过序列结合的原理预测得到。从生物学上来说，miRNA结合位点的附近同时会有Ago2的结合。我司在做靶基因分析的时候同时考虑了这一因素，靶基因预测的结果更可信（限于人的数据）

5.   miRNA靶基因GO注释和KEGG通路分析

6. ceRNA调控网络

Yvonne Tay, John Rinn，Nature 2014

上图为miRNA 的ceRNA 调控网络

7. 定制图表（可结合数据的特点双方沟通决定）

8. 定制个性化分析（可结合数据的特点双方沟通决定）

参考文献：

[1]Bleckmann, A., et al.Integrated miRNA and mRNA profiling of tumor-educated macrophages identifies prognostic subgroups in estrogen receptor-positive breast cancerMolecular Oncology (2014)

[2] Yvonne Tay, John Rinn  et al. The multilayered complexity of ceRNA crosstalk and competition Nature. 2014 January 16; 505(7483): 344–352